MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 8783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021881	TGTGA	2	10	220928	220937	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021881	TG	3	6	220965	220970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021881	CTTT	2	8	221001	221008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_021881	TGAT	2	8	221027	221034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021881	GGAA	2	8	221035	221042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021881	GT	3	6	221052	221057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021881	ACAGAA	2	12	221229	221240	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1008	NC_021881	TTA	2	6	223167	223172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021881	ATG	2	6	223220	223225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021881	TAC	2	6	224210	224215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_021881	GTTT	2	8	224557	224564	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021881	CAA	2	6	224648	224653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_021881	ACC	2	6	224667	224672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_021881	ACGC	2	8	224680	224687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_021881	AAC	2	6	224694	224699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_021881	CAA	2	6	225156	225161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_021881	CTAG	2	8	225274	225281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_021881	GTG	2	6	225347	225352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021881	AT	3	6	225419	225424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021881	ATTCT	2	10	225456	225465	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_021881	GTAA	2	8	225530	225537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021881	AGC	3	9	226112	226120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_021881	AAC	2	6	226142	226147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021881	TAG	2	6	226169	226174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021881	CT	3	6	226196	226201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_021881	AAT	2	6	226202	226207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021881	GATTG	2	10	226530	226539	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021881	TAG	2	6	227068	227073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021881	TAA	2	6	227099	227104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021881	CAAT	2	8	227257	227264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_021881	AT	3	6	227299	227304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021881	GCC	2	6	227307	227312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_021881	TGC	2	6	227315	227320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_021881	ATC	2	6	227328	227333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021881	CTA	2	6	227349	227354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_021881	TAA	2	6	227359	227364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021881	AC	3	6	227383	227388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_021881	AACA	2	8	227389	227396	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_021881	GGT	2	6	229636	229641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021881	TGC	2	6	229663	229668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021881	TGG	2	6	229692	229697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021881	TTC	2	6	229742	229747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_021881	TGT	2	6	229794	229799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021881	A	6	6	229817	229822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021881	TTGT	2	8	229840	229847	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021881	A	6	6	230637	230642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021881	TA	3	6	230734	230739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021881	GT	4	8	230753	230760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021881	A	7	7	231681	231687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021881	CTG	2	6	231700	231705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_021881	AGG	2	6	231714	231719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021881	CTG	2	6	231720	231725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_021881	TAT	2	6	231781	231786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021881	CTG	2	6	231789	231794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_021881	GTT	2	6	231810	231815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021881	GTA	2	6	231820	231825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021881	GTTT	2	8	231839	231846	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021881	TG	3	6	231934	231939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021881	AT	3	6	231951	231956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021881	GTA	2	6	233638	233643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021881	TCC	2	6	233650	233655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_021881	TAC	2	6	233688	233693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_021881	CATA	2	8	236309	236316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_021881	GTAT	2	8	236321	236328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021881	A	6	6	236337	236342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021881	AC	3	6	236397	236402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_021881	ATTT	2	8	236416	236423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021881	AAG	2	6	236477	236482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021881	TTG	2	6	237295	237300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021881	TG	3	6	237314	237319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021881	AGT	2	6	237365	237370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021881	TCC	2	6	237704	237709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_021881	TGC	2	6	237997	238002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_021881	AGA	2	6	238070	238075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021881	ACT	2	6	238105	238110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_021881	AGT	2	6	238171	238176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021881	AGA	2	6	238272	238277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021881	CCT	2	6	240090	240095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_021881	AACA	2	8	240113	240120	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_021881	TCA	2	6	240446	240451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_021881	TA	3	6	240476	240481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021881	T	6	6	240519	240524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021881	A	7	7	240543	240549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021881	AAAG	2	8	240573	240580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021881	GT	3	6	240582	240587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021881	AGTT	2	8	240607	240614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021881	CAC	2	6	240660	240665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_021881	GGA	2	6	241374	241379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021881	TA	3	6	241425	241430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021881	ATT	2	6	241436	241441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021881	GA	3	6	242128	242133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021881	AATA	2	8	242177	242184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021881	CTG	2	6	242279	242284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_021881	TACTA	2	10	242314	242323	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1095	NC_021881	GCT	2	6	242392	242397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_021881	CAG	2	6	242402	242407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_021881	TCTT	2	8	242440	242447	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_021881	TCT	2	6	242482	242487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_021881	CAG	2	6	242502	242507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_021881	ACA	2	6	243907	243912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_021881	CA	3	6	243911	243916	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_021881	ATG	2	6	244653	244658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021881	T	7	7	246191	246197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021881	AAT	2	6	246230	246235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021881	TA	3	6	246242	246247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021881	AG	3	6	246274	246279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021881	AAT	2	6	246292	246297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021881	AT	3	6	246310	246315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021881	CGAGGA	2	12	246331	246342	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1110	NC_021881	TG	3	6	246400	246405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021881	TTTG	2	8	246828	246835	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021881	TAA	2	6	250141	250146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021881	TAC	2	6	250160	250165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_021881	ATA	2	6	250274	250279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021881	CT	3	6	250316	250321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_021881	TAA	2	6	250355	250360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021881	TAAC	2	8	250380	250387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_021881	CCTAT	2	10	250432	250441	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1119	NC_021881	TTG	2	6	250449	250454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021881	AAT	2	6	250459	250464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021881	GTC	2	6	250481	250486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_021881	AGT	2	6	250491	250496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021881	TAC	2	6	250507	250512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_021881	CAT	2	6	250538	250543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_021881	TA	3	6	250560	250565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021881	AGT	2	6	250566	250571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021881	GAA	2	6	250608	250613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021881	GAG	2	6	250784	250789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021881	CAA	2	6	250811	250816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021881	GCT	2	6	250990	250995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_021881	TGA	2	6	251029	251034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021881	T	6	6	251271	251276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021881	AGT	2	6	251305	251310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021881	TTC	2	6	251341	251346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_021881	TGC	2	6	251374	251379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_021881	GCA	2	6	251387	251392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_021881	TGT	3	9	251452	251460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_021881	ATAG	2	8	251526	251533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_021881	GATA	2	8	251561	251568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_021881	TGT	2	6	251610	251615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_021881	AAG	2	6	251621	251626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_021881	ATAG	2	8	251628	251635	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_021881	GTAG	2	8	251685	251692	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_021881	CGC	2	6	252692	252697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1146	NC_021881	TGGC	2	8	252788	252795	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1147	NC_021881	GTA	2	6	252816	252821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1155	NC_021881	TGC	2	6	261669	261674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1163	NC_021881	T	6	6	262470	262475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1164	NC_021881	AT	3	6	262491	262496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1165	NC_021881	ATT	2	6	264660	264665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1244	NC_021881	TGT	2	6	297805	297810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1245	NC_021881	GTT	2	6	297823	297828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1246	NC_021881	TTGA	2	8	297866	297873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_021881	TTA	2	6	297878	297883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1259	NC_021881	GAT	2	6	300707	300712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1264	NC_021881	GGT	2	6	303140	303145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1269	NC_021881	ATG	2	6	303560	303565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_021881	GCT	2	6	303595	303600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1414	NC_021881	T	7	7	329830	329836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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